Engenheiro químico formado pela UFRJ, com mestrado e doutorado em Engenharia Química pela Coppe/UFRJ. Na área científica, atuou como engenheiro pesquisador na Coppe/UFRJ, no Grupo de Biotecnologia, por 10 anos, participando de diversos projetos científicos e tecnológicos, publicando trabalhos acadêmicos em nível nacional e internacional. No setor empresarial, ingressou na Tobasa aos 23 anos, companhia S/A de capital fechado, como diretor industrial em 1986, cuja bioindústria foi fundada pelo seu pai há 56 anos. Desde 2001, como sucessor do fundador, exerce o cargo de diretor-presidente. Em sua gestão, a Tobasa recebeu diversos prêmios e reconhecimentos na temática da Bioeconomia, gerando impacto socioambiental positivo e benefício climático pelo forte incentivo à conservação da biodiversidade regional. Em 2022, a companhia torna-se o primeiro caso emblemático de financiamento do mercado de capitais a um projeto de “Bioeconomia na Amazônia”, ao emitir o “1º CRA do Mundo a partir de Floresta Nativa”, promovendo o “IPO” deste CRA na Bolsa de Valores de SP (B3), em parceria com a Ecoagro e a JGP. A partir de 2021, Baruque Filho assumiu, também, a presidência do Conselho de Administração.